שפן סלעים הוא יונק קטן. אורכו המרבי הוא כ-60 ס"מ. משקלו עשוי להגיע ל-3 ק"ג. לאורך כל גופו קיימות שערות צפופות המסייעות לו לבודד את חום גופו ולהסוואתו בין צבעי השטח. צבעו של שפן סלעים הוא חום.

שפן הסלעים הוא מטפס סלעים מומחה. את מרבית חייהם הם מבלים על סלעים גדולים או בסביבתם. התנהגות זו נזכרה עוד בתקופת המקרא: "סלעים מחסה לשפנים" (תהילים ק"ד, פסוק 18). הסלעים מספקים לשפן הסלע הגנה מסוימת מפני טורפים אפשריים. כבדות רגליו של הטורף בסביבה הסלעית מאפשרת לשפן הסלעים להימלט בקלילות מפני סכנות האורבות מן הקרקע.

שפן הסלעים פעיל במשך שעות היום. הוא יוצא ממאורתו עם הזריחה ושב אליה בשקיעה. בבקרים הוא מגיח אל סלעים עליהם השמש יוקדת. כך הוא מחמם במעט את טמפרטורת גופו מקור הלילה. לרוב מופיע שפן סלעים בקבוצות צפופות. לקראת סוף היום שבים שפני סלע אל מחילות אותם הם מוצאים מן המוכן. שפן הסלע אינו בונה את מאורתו אלא משתכן במחילה קיימת. המחילה אחת עשויים להימצא עשרות פריטים קרובים זה לזה.

תזונתו של שפן סלעים היא צמחית.